RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 IDH3AP50213 366 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP17L24Q0WX57 530 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 PCSK7Q16549 785 aa9.54□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 FAM196BA6NMK8 535 aa9.53□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 CPB1P15086 417 aa9.53□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 INPP5BP32019 993 aa9.53□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.53□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.53□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 USP21Q9UK80 565 aa9.53□□□□□ -0.88
USP15-218ENST00000552346 MAP3K6O95382 1288 aa9.52□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 ILDR2Q71H61 639 aa9.52□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.52□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 ARSDP51689 593 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 DGKZQ13574 1117 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 ARTNQ5T4W7 220 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 MSL1Q68DK7 614 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 TP53INP1Q96A56 240 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 ZFATQ9P243 1243 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 PERM1Q5SV97 790 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 IFT43Q96FT9 208 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 FOXO3O43524 673 aa9.48□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 SASH3O75995 380 aa9.48□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 MICAL2O94851 1124 aa9.48□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 RARAP10276 462 aa9.48□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 GRIK5Q16478 980 aa9.48□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.48□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 WEE1P30291 646 aa9.47□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 PLAURQ03405 335 aa9.47□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.47□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 FBXO11Q86XK2 927 aa9.47□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.47□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
USP15-218ENST00000552346 GPLD1P80108 840 aa9.46□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 MYO19Q96H55 970 aa9.46□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 NBPF11Q86T75 865 aa9.45□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.45□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 TTC9Q92623 222 aa9.45□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.44□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 USP20Q9Y2K6 914 aa9.44□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 OPLAHO14841 1288 aa9.43□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 NRLP54845 237 aa9.43□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 LRP8Q14114 963 aa9.43□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.43□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 NOS3P29474 1203 aa9.42□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.42□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.42□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 XYLBO75191 536 aa9.41□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 EGFRP00533 1210 aa9.4□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 TREML1Q86YW5 311 aa9.4□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.4□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
USP15-218ENST00000552346 CDCA8Q53HL2 280 aa9.39□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.39□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.39□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.38□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 PSAPP07602 524 aa9.38□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 RFX1P22670 979 aa9.38□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 PLD4Q96BZ4 506 aa9.38□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.38□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.38□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.37□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 J3QW42 95 aa9.37□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 DLL1O00548 723 aa9.37□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 SIK1P57059 783 aa9.37□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 COX20Q5RI15 118 aa9.37□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 MMP20O60882 483 aa9.36□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 GHRHP01286 108 aa9.36□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.36□□□□□ -0.91
USP15-218ENST00000552346 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms