RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551887.2

ITGB7-211, Transcript of integrin subunit beta 7, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB7, Length 760 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7-211ENST00000551887 ANKRD62A6NC57 917 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 MMP10P09238 476 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 ATP6V1AP38606 617 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 ITPK1Q13572 414 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 FBXW7Q969H0 707 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 A0A0G2JLW4 131 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CCP110O43303 1012 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 OFD1O75665 1012 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 EYA1Q99502 592 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 ATG3Q9NT62 314 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 SH3BP5O60239 455 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 PHKG2P15735 406 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 KCNJ4P48050 445 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 LBX1P52954 281 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 IFNL2Q8IZJ0 200 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CFAP53Q96M91 514 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 BCS1LQ9Y276 419 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 LY75O60449 1722 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 FAM200BP0CF97 657 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 TGFB2P61812 414 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 NFKBIBQ15653 356 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 POLKQ9UBT6 870 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 PPFIA4O75335 1185 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 DPEP1P16444 411 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CASQ1P31415 396 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 RHBDL3P58872 404 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 SMC5Q8IY18 1101 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 BORCS6Q96GS4 357 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 COMMD10Q9Y6G5 202 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CBFA2T2O43439 604 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 FCHSD2O94868 740 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 PRR29P0C7W0 189 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 RFC4P35249 363 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 ATL2Q8NHH9 583 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 C4BP0C0L5 1744 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.27□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
ITGB7-211ENST00000551887 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB7-211ENST00000551887 CREB3O43889 395 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB7-211ENST00000551887 GYS1P13807 737 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB7-211ENST00000551887 GUCY2CP25092 1073 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB7-211ENST00000551887 CABP4P57796 275 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB7-211ENST00000551887 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ITGB7-211ENST00000551887 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB7-211ENST00000551887 GCC1Q96CN9 775 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB7-211ENST00000551887 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB7-211ENST00000551887 NCAPD2Q15021 1401 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB7-211ENST00000551887 C5P01031 1676 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms