RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 LAMB4A4D0S4 1761 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 COL15A1P39059 1388 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 GORABQ5T7V8 394 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 AMIGO3Q86WK7 504 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 SH3TC1Q8TE82 1336 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GUL7 405 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 NPHP1O15259 732 aa10.23□□□□□ -0.77
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CS-215ENST00000549143 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
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CS-215ENST00000549143 METTL24Q5JXM2 366 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.22□□□□□ -0.77
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CS-215ENST00000549143 FAM227BQ96M60 508 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 CSF1RP07333 972 aa10.22□□□□□ -0.77
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CS-215ENST00000549143 ZNF652Q9Y2D9 606 aa10.22□□□□□ -0.77
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CS-215ENST00000549143 ZPR1O75312 459 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 PALD1Q9ULE6 856 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 ADORA1P30542 326 aa10.21□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
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CS-215ENST00000549143 SGSM2O43147 1006 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.2□□□□□ -0.78
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CS-215ENST00000549143 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
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CS-215ENST00000549143 KCNJ4P48050 445 aa10.2□□□□□ -0.78
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CS-215ENST00000549143 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 CDHR2Q9BYE9 1310 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 TAF5LO75529 589 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 ATP5JP18859 108 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 MCCP23508 829 aa10.2□□□□□ -0.78
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CS-215ENST00000549143 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
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CS-215ENST00000549143 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
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CS-215ENST00000549143 RUFY2Q8WXA3 655 aa10.19□□□□□ -0.78
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CS-215ENST00000549143 A0A0D9SFI3 127 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 CIAO1O76071 339 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 NTSR2O95665 410 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 PTH1RQ03431 593 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 RABEP1Q15276 862 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 PI16Q6UXB8 463 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 SETDB2Q96T68 719 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 CCDC158Q5M9N0 1113 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 ANTXR1Q9H6X2 564 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 WNK3Q9BYP7 1800 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 ATRNO75882 1429 aa10.18□□□□□ -0.78
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CS-215ENST00000549143 TTC39AQ5SRH9 613 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 CLEC4GQ6UXB4 293 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.18□□□□□ -0.78
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CS-215ENST00000549143 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 AKAP2Q9Y2D5 859 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 CCDC152Q4G0S7 254 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 ST18O60284 1047 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 SNX21Q969T3 373 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 HAUS7Q99871 368 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 PAG1Q9NWQ8 432 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-215ENST00000549143 NARFQ9UHQ1 456 aa10.17□□□□□ -0.78
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