RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 NBPF26B4DH59 902 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 UFL1O94874 794 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 CAMTA2O94983 1202 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 SLFN5Q08AF3 891 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 NBPF15Q8N660 670 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-206ENST00000548122 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 SUSD4Q5VX71 490 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 OGFOD1Q8N543 542 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF592Q92610 1267 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ABCA3Q99758 1704 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 RPS8P62241 208 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 GGA1Q9UJY5 639 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 NLRP10Q86W26 655 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 GRM8O00222 908 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 VAMP4O75379 141 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 BBOX1O75936 387 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 G2E3Q7L622 706 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 PTPRCP08575 1304 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 DDR1Q08345 913 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ALDH1L1O75891 902 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 GNAI2P04899 355 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 H7C1D1 291 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 WASHC4Q2M389 1173 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 NRAPQ86VF7 1730 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 PEAK1Q9H792 1746 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 LRRC37A3O60309 1634 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 SRGAP3O43295 1099 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 COG6Q9Y2V7 657 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRB-206ENST00000548122 LMNB1P20700 586 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-206ENST00000548122 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 GPATCH3Q96I76 525 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 PAF1Q8N7H5 531 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 MYO1BO43795 1136 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 BCAR3O75815 825 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ITGA6P23229 1130 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 STYK1Q6J9G0 422 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 TNIP1Q15025 636 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 SYNE4Q8N205 404 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-206ENST00000548122 NF2P35240 595 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 CTSWP56202 376 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 GRAPQ13588 217 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 DOK7Q18PE1 504 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 WDR78Q5VTH9 848 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 RAD17O75943 681 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 RASSF7Q02833 373 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-206ENST00000548122 FAM161AQ3B820 660 aa6.72□□□□□ -1.33
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