RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542207.5

RNF10-215, Transcript of ring finger protein 10, human

TSL 4

Gene RNF10, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF10-215	ENST00000542207	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	PLSCR1	O15162	318 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	PHF14	O94880	888 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	ITGA6	P23229	1130 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	TFCP2	Q12800	502 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	ZNF609	O15014	1411 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	LRP5	O75197	1615 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	NPHP1	O15259	732 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	REC8	O95072	547 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	APBA3	O96018	575 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	GREM2	Q9H772	168 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	MYH3	P11055	1940 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	HIP1	O00291	1037 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	SEC24B	O95487	1268 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNF10-215	ENST00000542207	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	MCC	P23508	829 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	POTEA	Q6S8J7	498 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207		A0A1B0GUL7	405 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	ATP5J	P18859	108 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	BECN1	Q14457	450 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	CHML	P26374	656 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	ST5	P78524	1137 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF10-215	ENST00000542207	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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