RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536509.5

LMO3-214, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-214ENST00000536509 EPS15P42566 896 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 RIPK4P57078 832 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 PDIA6Q15084 440 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 RALBP1Q15311 655 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 TMC4Q7Z404 712 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 SP8Q8IXZ3 490 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 ABCC4O15439 1325 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 AOC3Q16853 763 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 LBX1P52954 281 aa14.52□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 TNIP1Q15025 636 aa14.52□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.52□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 CXCL9Q07325 125 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 TCIRG1Q13488 830 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 COPS6Q7L5N1 327 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 NLRP10Q86W26 655 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 MPNDQ8N594 471 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 CAPNS2Q96L46 248 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 MAP2K2P36507 400 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 PROSER3Q2NL68 480 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 HOXB7P09629 217 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 GRAPQ13588 217 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 CST9Q5W186 159 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 CHL1O00533 1208 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 CA12O43570 354 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 ANXA1P04083 346 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 TAF1P21675 1872 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 TRAF5O00463 557 aa14.47□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.47□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.47□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 H7C1D1 291 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 DPF2Q92785 391 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 RUNDC1Q96C34 613 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
LMO3-214ENST00000536509 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 RAD17O75943 681 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 SLC51AQ86UW1 340 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 NECTIN2Q92692 538 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 ABHD8Q96I13 439 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 HYPKQ9NX55 129 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 GRM1Q13255 1194 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 WASHC4Q2M389 1173 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.43□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 NEUROD2Q15784 382 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 EYA3Q99504 573 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 YDJCA8MPS7 323 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 NOGQ13253 232 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 MICALL2Q8IY33 904 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-214ENST00000536509 CFAP44Q96MT7 982 aa14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms