RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	FBXO3	Q9UK99	471 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	UTRN	P46939	3433 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	GNPAT	O15228	680 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	PDE8A	O60658	829 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	CSF1R	P07333	972 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	ZPR1	O75312	459 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	CIAO1	O76071	339 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	RILPL2	Q969X0	211 aa		18.78	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	NUP98	P52948	1817 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	CTSW	P56202	376 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	SUSD4	Q5VX71	490 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	NARF	Q9UHQ1	456 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		18.77	■□□□□ 0.6
ATG13-222	ENST00000534610	EYA2	O00167	538 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	TFCP2	Q12800	502 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	CNTROB	Q8N137	903 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	C4B	P0C0L5	1744 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	GPR108	Q9NPR9	543 aa		18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	FAM177B	A6PVY3	158 aa		18.75	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		18.75	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	RFC4	P35249	363 aa		18.74	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	TNNI3K	Q59H18	835 aa		18.74	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		18.74	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	SYNE4	Q8N205	404 aa		18.74	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		18.74	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		18.74	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	ADRA2B	P18089	450 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	MTFR1L	Q9H019	292 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	ITGA6	P23229	1130 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	SETDB2	Q96T68	719 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	NYX	Q9GZU5	481 aa		18.73	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	REC8	O95072	547 aa		18.72	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	NTSR2	O95665	410 aa		18.72	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		18.71	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		18.71	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	GREM2	Q9H772	168 aa		18.71	■□□□□ 0.59
ATG13-222	ENST00000534610	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	LRRC24	Q50LG9	513 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	SMIM5	Q71RC9	77 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	EVI5L	Q96CN4	794 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	PHF14	O94880	888 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	CHML	P26374	656 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	BECN1	Q14457	450 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	ATP5J	P18859	108 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	HIP1	O00291	1037 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	METTL24	Q5JXM2	366 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-222	ENST00000534610	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.1 ms