RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 XYLBO75191 536 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 IRS1P35568 1242 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 SASH3O75995 380 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 RARAP10276 462 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 KCNMA1Q12791 1236 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB39O15060 712 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ABL1P00519 1130 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 GPR152Q8TDT2 470 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 MDFIQ99750 246 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 DGKGP49619 791 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 MTMR3Q13615 1198 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 KANK3Q6NY19 840 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ZFATQ9P243 1243 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 PIK3R2O00459 728 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 EGFRP00533 1210 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 MPSTP25325 297 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 RASSF7Q02833 373 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ATCAYQ86WG3 371 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 MAP3K6O95382 1288 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 M0R082 166 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 GNB5O14775 395 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 AAMPQ13685 434 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 PCSK7Q16549 785 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 GDF11O95390 407 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ALBP02768 609 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 NLRP13Q86W25 1043 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 EDEM1Q92611 657 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 PSAPP07602 524 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 PCSK2P16519 638 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 GSK3AP49840 483 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-214ENST00000530727 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 MMP20O60882 483 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 FAM13AO94988 1023 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 FAM35AQ86V20 835 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 TTC16Q8NEE8 873 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 CPB1P15086 417 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 SERPINB4P48594 390 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 GPLD1P80108 840 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 PLAURQ03405 335 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 NUDT8Q8WV74 236 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 NAGPAQ9UK23 515 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 LILRB5O75023 590 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 NRLP54845 237 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 SMARCA2P51531 1590 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 H3BRB1 525 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 PDGFAP04085 211 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 NPR3P17342 541 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-214ENST00000530727 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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