RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 LRRC24Q50LG9 513 aa28.31■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 AK7Q96M32 723 aa28.31■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 RGL2O15211 777 aa28.31■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 KIF2CQ99661 725 aa28.31■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.3■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.3■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 RPS6KA4O75676 772 aa28.3■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 EVI5LQ96CN4 794 aa28.29■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.29■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.28■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.28■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 GREM2Q9H772 168 aa28.28■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 SCN7AQ01118 1682 aa28.28■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.28■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.28■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 ITGA6P23229 1130 aa28.27■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 ATP5JP18859 108 aa28.27■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 DBNDD2Q9BQY9 259 aa28.27■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 NTSR2O95665 410 aa28.26■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 ZNF609O15014 1411 aa28.26■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.25■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 GNPATO15228 680 aa28.25■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.25■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.25■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 FAM177BA6PVY3 158 aa28.24■■■□□ 2.11
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ACER3-204ENST00000525861 NARFQ9UHQ1 456 aa28.24■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 LAMB2P55268 1798 aa28.23■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 C4BP0C0L5 1744 aa28.23■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 SGSM2O43147 1006 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 SNX21Q969T3 373 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 IL25Q9H293 177 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 ANO2Q9NQ90 1003 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.21■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 A0A1B0GUL7 405 aa28.2■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 TIMM10P62072 90 aa28.2■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa28.2■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.2■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.2■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.2■■■□□ 2.11
ACER3-204ENST00000525861 SMIM5Q71RC9 77 aa28.2■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 LRP5O75197 1615 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 HIP1O00291 1037 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 HSCBQ8IWL3 235 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 RABEP1Q15276 862 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.19■■■□□ 2.1
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ACER3-204ENST00000525861 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.18■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 HAUS7Q99871 368 aa28.17■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.17■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 RTL9Q8NET4 1388 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 MCCP23508 829 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
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ACER3-204ENST00000525861 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 METTL24Q5JXM2 366 aa28.15■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 TRIM37O94972 964 aa28.15■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.14■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 C4AP0C0L4 1744 aa28.14■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 EP400Q96L91 3159 aa28.14■■■□□ 2.1
ACER3-204ENST00000525861 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.14■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.14■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 RAD50Q92878 1312 aa28.13■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
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ACER3-204ENST00000525861 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.12■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 ANAPC15P60006 121 aa28.12■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 ERFEQ4G0M1 354 aa28.12■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.12■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.12■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 SETDB2Q96T68 719 aa28.12■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 ATP2B3Q16720 1220 aa28.11■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 XAGE2Q96GT9 111 aa28.11■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 NYXQ9GZU5 481 aa28.11■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 ADRA2BP18089 450 aa28.11■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 RFC4P35249 363 aa28.11■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 IL17RAQ96F46 866 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-204ENST00000525861 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.1■■■□□ 2.09
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