RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 ABCC4O15439 1325 aa20.99■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 H7C1W4 665 aa20.98■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 C21orf2O43822 256 aa20.98■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 PRELPP51888 382 aa20.98■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 OLFM4Q6UX06 510 aa20.98■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 BCAR3O75815 825 aa20.97■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 RASSF7Q02833 373 aa20.97■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.97■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.97■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.97■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 RRAGCQ9HB90 399 aa20.97■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 NFKBIEO00221 500 aa20.96■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 KIF16BQ96L93 1317 aa20.96■□□□□ 0.95
HACE1-211ENST00000521962 ALDH1B1P30837 517 aa20.95■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.95■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.94■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 PDE8AO60658 829 aa20.94■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 ALDH1L1O75891 902 aa20.94■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.94■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 TAF1P21675 1872 aa20.93■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 CTSWP56202 376 aa20.93■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.93■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 TNNQ9UQP3 1299 aa20.93■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.92■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 GRM8O00222 908 aa20.92■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 LMNB1P20700 586 aa20.92■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 GRAPQ13588 217 aa20.92■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.92■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 GLTPD2A6NH11 291 aa20.91■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.91■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 UTYO14607 1347 aa20.9■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.9■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 TRIM27P14373 513 aa20.9■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 CCDC93Q567U6 631 aa20.9■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.9■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.9■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 MYH3P11055 1940 aa20.9■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HACE1-211ENST00000521962 RTL9Q8NET4 1388 aa20.89■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.89■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 SOGA3Q5TF21 947 aa20.89■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 FOXO4P98177 505 aa20.88■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.88■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 KAZALD1Q96I82 304 aa20.88■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 GREM2Q9H772 168 aa20.88■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.88■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.88■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 SUCLG2Q96I99 432 aa20.87■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.87■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 LTBP1Q14766 1721 aa20.87■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 POTECB2RU33 542 aa20.86■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 BBOX1O75936 387 aa20.86■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 CSF1RP07333 972 aa20.86■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 FAM161AQ3B820 660 aa20.86■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.86■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 USP44Q9H0E7 712 aa20.86■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 COL4A5P29400 1685 aa20.85■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.84■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 SP8Q8IXZ3 490 aa20.84■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.84■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.83■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.83■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 PSMD1Q99460 953 aa20.83■□□□□ 0.93
HACE1-211ENST00000521962 TMC4Q7Z404 712 aa20.82■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.82■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 SPEF2Q9C093 1822 aa20.81■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 ITGA6P23229 1130 aa20.81■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.81■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.81■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 RLBP1P12271 317 aa20.8■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 MEIS3Q99687 375 aa20.8■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms