RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520837.5

TSPAN18-208, Transcript of tetraspanin 18, human

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN18-208	ENST00000520837	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	NTSR2	O95665	410 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	AAMP	Q13685	434 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	MYD88	Q99836	296 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	PTPRC	P08575	1304 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	C21orf2	O43822	256 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	SRGN	P10124	158 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	RLBP1	P12271	317 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	NPR1	P16066	1061 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	RASSF7	Q02833	373 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	G2E3	Q7L622	706 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	HTRA3	P83110	453 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	RNF181	Q9P0P0	153 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TSPAN18-208	ENST00000520837	LAMB2	P55268	1798 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	SBF1	O95248	1867 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	TOMM70	O94826	608 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	FLII	Q13045	1269 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	TAF1	P21675	1872 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	PRELP	P51888	382 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	ABCC4	O15439	1325 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	NFKBIE	O00221	500 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	APLP1	P51693	650 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	POLA2	Q14181	598 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	SOGA3	Q5TF21	947 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837		F6X3S4	739 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	LMNB1	P20700	586 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TSPAN18-208	ENST00000520837	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55

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