RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 FOXO4P98177 505 aa12.93□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 SMIM5Q71RC9 77 aa12.93□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 FAM89AQ96GI7 184 aa12.93□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 LNPKQ9C0E8 428 aa12.93□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 UBN2Q6ZU65 1347 aa12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 PHF14O94880 888 aa12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 C4BP0C0L5 1744 aa12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 SSFA2P28290 1259 aa12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 SUSD4Q5VX71 490 aa12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 LMBR1LQ6UX01 489 aa12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 PLA2G12BQ9BX93 195 aa12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 APBB1O00213 710 aa12.91□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 PYGBP11216 843 aa12.91□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 AMIGO3Q86WK7 504 aa12.91□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 LRRCC1Q9C099 1032 aa12.91□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 BCL2L12Q9HB09 334 aa12.91□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 PDE8AO60658 829 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 PDE4AP27815 886 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 ERC1Q8IUD2 1116 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 PHF12Q96QT6 1004 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 SETDB2Q96T68 719 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 STK24Q9Y6E0 443 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-210ENST00000519815 FAM177BA6PVY3 158 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CSF1RP07333 972 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 TBC1D9BQ66K14 1250 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 BICDL1Q6ZP65 573 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 SYNE4Q8N205 404 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 FLAD1Q8NFF5 587 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 KIF1BPQ96EK5 621 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CAMKK2Q96RR4 588 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 COPRSQ9NQ92 184 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 NTSR2O95665 410 aa12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 BAG6P46379 1132 aa12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC57Q2TAC2 916 aa12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 RHPN1Q8TCX5 695 aa12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 NYXQ9GZU5 481 aa12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 NUP98P52948 1817 aa12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CTSWP56202 376 aa12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF827Q17R98 1081 aa12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC125Q86Z20 511 aa12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 TTLL11Q8NHH1 800 aa12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 SLC10A5Q5PT55 438 aa12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 TPTE2Q6XPS3 522 aa12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 BCL11AQ9H165 835 aa12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 BCORQ6W2J9 1755 aa12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 GYS1P13807 737 aa12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 NFIXQ14938 502 aa12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 ERFEQ4G0M1 354 aa12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 SIL1Q9H173 461 aa12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 SCN7AQ01118 1682 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CIAO1O76071 339 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 SASH1O94885 1247 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 FAM161AQ3B820 660 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC152Q4G0S7 254 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 STK32BQ9NY57 414 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CARMIL3Q8ND23 1372 aa12.83□□□□□ -0.36
TRPS1-210ENST00000519815 EYA2O00167 538 aa12.83□□□□□ -0.36
TRPS1-210ENST00000519815 ITGA6P23229 1130 aa12.83□□□□□ -0.36
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