RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 PANK2Q9BZ23 570 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF26B4DH59 902 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF14Q5TI25 921 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF15Q8N660 670 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 GOLIM4O00461 696 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 MCM2P49736 904 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 METTL24Q5JXM2 366 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 BANK1Q8NDB2 785 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 STAP2Q9UGK3 403 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 NWD1Q149M9 1564 aa9.32□□□□□ -0.92
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TRPS1-208ENST00000519076 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 PALD1Q9ULE6 856 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 SASH1O94885 1247 aa9.32□□□□□ -0.92
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TRPS1-208ENST00000519076 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 TMX3Q96JJ7 454 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CPA1P15085 419 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 FAM227BQ96M60 508 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 MPHOSPH8Q99549 860 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 SGSM2O43147 1006 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 DTNBO60941 627 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 UQCRHP07919 91 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 TNNI3KQ59H18 835 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 PI4K2BQ8TCG2 481 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 STK3Q13188 491 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 GPATCH11Q8N954 259 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 EFCC1Q9HA90 598 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 KIF1AQ12756 1690 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 TCIRG1Q13488 830 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 MTX1Q13505 466 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 KIF2CQ99661 725 aa9.3□□□□□ -0.92
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TRPS1-208ENST00000519076 PSMA5P28066 241 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 ANAPC15P60006 121 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 ATG3Q9NT62 314 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 AOX1Q06278 1338 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC66A2RUB6 948 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 KCNQ4P56696 695 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 KAZALD1Q96I82 304 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 TOMM22Q9NS69 142 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 PRR29P0C7W0 189 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC24Q50LG9 513 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 COPRSQ9NQ92 184 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GUL7 405 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 EYA2O00167 538 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 FAM182BQ5T319 152 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 FOSBP53539 338 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 VPS37DQ86XT2 251 aa9.28□□□□□ -0.92
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