RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 MAP2K3P46734 347 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 ECM1Q16610 540 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 RGL4Q8IZJ4 473 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa10.36□□□□□ -0.75
PDE4D-225ENST00000515835 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
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PDE4D-225ENST00000515835 GRIN2AQ12879 1464 aa10.36□□□□□ -0.75
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PDE4D-225ENST00000515835 IGF1RP08069 1367 aa10.34□□□□□ -0.75
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PDE4D-225ENST00000515835 GPR152Q8TDT2 470 aa10.33□□□□□ -0.76
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PDE4D-225ENST00000515835 USP20Q9Y2K6 914 aa10.32□□□□□ -0.76
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PDE4D-225ENST00000515835 ADAMTS2O95450 1211 aa10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-225ENST00000515835 SLURP2P0DP57 97 aa10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-225ENST00000515835 ARAFP10398 606 aa10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-225ENST00000515835 GRIN2CQ14957 1233 aa10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PDE4D-225ENST00000515835 EDEM1Q92611 657 aa10.31□□□□□ -0.76
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PDE4D-225ENST00000515835 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PDE4D-225ENST00000515835 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
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PDE4D-225ENST00000515835 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.28□□□□□ -0.76
PDE4D-225ENST00000515835 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PDE4D-225ENST00000515835 PNMA5Q96PV4 448 aa10.28□□□□□ -0.76
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PDE4D-225ENST00000515835 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.28□□□□□ -0.76
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PDE4D-225ENST00000515835 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10.28□□□□□ -0.76
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PDE4D-225ENST00000515835 NDUFB5O43674 189 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-225ENST00000515835 SIN3BO75182 1162 aa10.27□□□□□ -0.77
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PDE4D-225ENST00000515835 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
PDE4D-225ENST00000515835 SYT9Q86SS6 491 aa10.27□□□□□ -0.77
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PDE4D-225ENST00000515835 CITED4Q96RK1 184 aa10.27□□□□□ -0.77
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PDE4D-225ENST00000515835 ACDQ96AP0 544 aa10.26□□□□□ -0.77
PDE4D-225ENST00000515835 KIF27Q86VH2 1401 aa10.25□□□□□ -0.77
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PDE4D-225ENST00000515835 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.25□□□□□ -0.77
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PDE4D-225ENST00000515835 NLRP13Q86W25 1043 aa10.25□□□□□ -0.77
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PDE4D-225ENST00000515835 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.25□□□□□ -0.77
PDE4D-225ENST00000515835 KLF15Q9UIH9 416 aa10.25□□□□□ -0.77
PDE4D-225ENST00000515835 SHROOM2Q13796 1616 aa10.25□□□□□ -0.77
PDE4D-225ENST00000515835 TARSP26639 723 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
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PDE4D-225ENST00000515835 KRT25Q7Z3Z0 450 aa10.23□□□□□ -0.77
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PDE4D-225ENST00000515835 ZFATQ9P243 1243 aa10.23□□□□□ -0.77
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PDE4D-225ENST00000515835 BCRP11274 1271 aa10.22□□□□□ -0.77
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PDE4D-225ENST00000515835 TNFRSF25Q93038 417 aa10.22□□□□□ -0.77
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