RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	NECTIN1	Q15223	517 aa		27.55	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		27.54	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	NLRP10	Q86W26	655 aa		27.54	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	MAP4K1	Q92918	833 aa		27.54	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	CSF1R	P07333	972 aa		27.53	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		27.53	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	FAM89A	Q96GI7	184 aa		27.53	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	ARX	Q96QS3	562 aa		27.53	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		27.53	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		27.52	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	PKP1	Q13835	747 aa		27.52	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PDE4D-223	ENST00000515011	NUP98	P52948	1817 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	RREB1	Q92766	1687 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	GPT	P24298	496 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	PALLD	Q8WX93	1383 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	TIMM10	P62072	90 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	TICAM2	Q86XR7	235 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	AK2	P54819	239 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	SPEF2	Q9C093	1822 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011		A0A1B0GUL7	405 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	KCNJ4	P48050	445 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	MYH3	P11055	1940 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	SLC27A2	O14975	620 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	VPS53	Q5VIR6	699 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	TAF5L	O75529	589 aa		27.45	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	27.45	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	27.45	■■□□□ 1.99
PDE4D-223	ENST00000515011	RUFY3	Q7L099	469 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	SYNE4	Q8N205	404 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	CTSW	P56202	376 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	RNF20	Q5VTR2	975 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	SIK1	P57059	783 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP6V1A	P38606	617 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	CPA1	P15085	419 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011		A0A0G2JS52	829 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	BRD1	O95696	1058 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	GOLIM4	O00461	696 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	PSMA5	P28066	241 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	27.41	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	GREM2	Q9H772	168 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	PDE8A	O60658	829 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	ITGA6	P23229	1130 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	ITPK1	Q13572	414 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		27.39	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	MCTP1	Q6DN14	999 aa		27.39	■■□□□ 1.97

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