RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		10.69	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		10.69	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	10.68	□□□□□ -0.7	2e-6	■■■■■ 96.1
PDE4D-222	ENST00000514552	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	PPFIA3	O75145	1194 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP4A	P20648	1035 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	TXLNA	P40222	546 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	GGT6	Q6P531	493 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	NLRP1	Q9C000	1473 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	ITGA6	P23229	1130 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	MIA2	Q96PC5	1412 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	GMCL1	Q96IK5	515 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	GPAM	Q9HCL2	828 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PDE4D-222	ENST00000514552	TNR	Q92752	1358 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552		H7C1W4	665 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	PGBD3	Q8N328	593 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	CPS1	P31327	1500 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	DEPDC5	O75140	1603 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	RTN1	Q16799	776 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCC3	O15438	1527 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552		H3BM21	787 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	KIF3B	O15066	747 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPY4	P0CV99	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPY10	P0CW01	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	MYO19	Q96H55	970 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	NGLY1	Q96IV0	654 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	ZIC5	Q96T25	663 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	RUBCNL	Q9H714	662 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	MED14	O60244	1454 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	BRD1	O95696	1058 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	EFHC2	Q5JST6	749 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1W2PNR3	127 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	DBN1	Q16643	649 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	HIF1A	Q16665	826 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	NLRP8	Q86W28	1048 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	MTMR7	Q9Y216	660 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PDE4D-222	ENST00000514552	ERVK-7	P63135	1459 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	VEGFB	P49765	207 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	C16orf46	Q6P387	395 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	SV2A	Q7L0J3	742 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDE4D-222	ENST00000514552	IQGAP1	P46940	1657 aa		10.57	□□□□□ -0.72

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