RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511481.5

SEC24D-211, Transcript of SEC24 homolog D, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24D, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24D-211ENST00000511481 RASA3Q14644 834 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 SPON2Q9BUD6 331 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 NOS2P35228 1153 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ETFBP38117 255 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 RAB33AQ14088 237 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 TEAD4Q15561 434 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 TMX1Q9H3N1 280 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 LILRA1O75019 489 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 TREML1Q86YW5 311 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 XAGE2Q96GT9 111 aa7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 DEPDC7Q96QD5 511 aa7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 TRIM55Q9BYV6 548 aa7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 POTECB2RU33 542 aa7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 AMPD3Q01432 767 aa7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 LRP10Q7Z4F1 713 aa7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 TTC16Q8NEE8 873 aa7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 EXOC6Q8TAG9 804 aa7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 SMARCA4P51532 1647 aa7□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 IL2RAP01589 272 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 NBPF15Q8N660 670 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 WNT2BQ93097 391 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 TLR1Q15399 786 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 SKAP1Q86WV1 359 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 CDC45O75419 566 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 TNFRSF21O75509 655 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 PRXQ9BXM0 1461 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 FSHRP23945 695 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 SOX9P48436 509 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 GORABQ5T7V8 394 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 GINM1Q9NU53 330 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 FANCLQ9NW38 375 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 NCOA2Q15596 1464 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 CDK15Q96Q40 435 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 BCS1LQ9Y276 419 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 CHMP4BP1P59074 171 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 XKR5Q6UX68 686 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 CNKSR1Q969H4 720 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SEC24D-211ENST00000511481 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 GRM5P41594 1212 aa6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 ARSHQ5FYA8 562 aa6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 MTRQ99707 1265 aa6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms