RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 FAM13BQ9NYF5 915 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 BCS1LQ9Y276 419 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 USP20Q9Y2K6 914 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 CHMP3Q9Y3E7 222 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 CUX2O14529 1486 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 EML1O00423 815 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 FZD6O60353 706 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 GNA15P30679 374 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 GJD3Q8N144 294 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF280CQ8ND82 737 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 C7orf43Q8WVR3 580 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 CRELD1Q96HD1 420 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 KLK14Q9P0G3 267 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 AK5Q9Y6K8 562 aa3.27□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 SLC27A3Q5K4L6 730 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.26□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 NBPF15Q8N660 670 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 MKL1Q969V6 931 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 HSH2DQ96JZ2 352 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 CABP1Q9NZU7 370 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 VTI1BQ9UEU0 232 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 PPFIA3O75145 1194 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 CLSTN1O94985 981 aa3.26□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 MPSTP25325 297 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 FZD5Q13467 585 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 NBPF11Q86T75 865 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 AIDAQ96BJ3 306 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 NOS2P35228 1153 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 PTSQ03393 145 aa3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 COX20Q5RI15 118 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 NLRP3Q96P20 1036 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF232Q9UNY5 417 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 SPG7Q9UQ90 795 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 CDK2AP1O14519 115 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 GRNP28799 593 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 NFE2L2Q16236 605 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 HIF1AQ16665 826 aa3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 TMC1Q8TDI8 760 aa3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 CAPN10Q9HC96 672 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 TNFRSF10BO14763 440 aa3.25□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 GPR25O00155 361 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 MAN1A2O60476 641 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 C1orf53Q5VUE5 145 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 GIMAP6Q6P9H5 292 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa3.24□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 RHBDD1Q8TEB9 315 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 CSRNP1Q96S65 589 aa3.24□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 PHACTR1Q9C0D0 580 aa3.24□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 A6NHS1 94 aa3.24□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 C11orf91Q3C1V1 193 aa3.24□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 GPR182O15218 404 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 HSD3B2P26439 372 aa3.23□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 ARTNQ5T4W7 220 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 HS2ST1Q7LGA3 356 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD24Q8TF21 1146 aa3.23□□□□□ -1.89
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