RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 NFKBIEO00221 500 aa22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 RASSF7Q02833 373 aa22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 OLFM4Q6UX06 510 aa22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 BBOX1O75936 387 aa22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRIM27P14373 513 aa22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 SLC51AQ86UW1 340 aa22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 UTYO14607 1347 aa22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 UTRNP46939 3433 aa22.7■■□□□ 1.23
RASGEF1B-205ENST00000507538 YY1P25490 414 aa22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 RTL9Q8NET4 1388 aa22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 SNED1Q8TER0 1413 aa22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 TMC4Q7Z404 712 aa22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 GREM2Q9H772 168 aa22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 CACNA1SQ13698 1873 aa22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 FOXO4P98177 505 aa22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 SP8Q8IXZ3 490 aa22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 USP44Q9H0E7 712 aa22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 TNNQ9UQP3 1299 aa22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 COL4A1P02462 1669 aa22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 CSF1RP07333 972 aa22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 LMNB1P20700 586 aa22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRELPP51888 382 aa22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 FAM161AQ3B820 660 aa22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 SUCLG2Q96I99 432 aa22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 RNF181Q9P0P0 153 aa22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.65■■□□□ 1.22
RASGEF1B-205ENST00000507538 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.64■■□□□ 1.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 KAZALD1Q96I82 304 aa22.64■■□□□ 1.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 PSMD1Q99460 953 aa22.64■■□□□ 1.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.63■■□□□ 1.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 ITGA6P23229 1130 aa22.63■■□□□ 1.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.63■■□□□ 1.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.63■■□□□ 1.21
RASGEF1B-205ENST00000507538 CHD4Q14839 1912 aa22.63■■□□□ 1.21
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RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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RASGEF1B-205ENST00000507538 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.61■■□□□ 1.21
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RASGEF1B-205ENST00000507538 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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RASGEF1B-205ENST00000507538 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.57■■□□□ 1.2
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RASGEF1B-205ENST00000507538 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.55■■□□□ 1.2
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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RASGEF1B-205ENST00000507538 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.55■■□□□ 1.2
RASGEF1B-205ENST00000507538 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.55■■□□□ 1.2
RASGEF1B-205ENST00000507538 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.55■■□□□ 1.2
RASGEF1B-205ENST00000507538 SBF1O95248 1867 aa22.54■■□□□ 1.2
RASGEF1B-205ENST00000507538 PPIP5K2O43314 1243 aa22.54■■□□□ 1.2
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RASGEF1B-205ENST00000507538 VPS33BQ9H267 617 aa22.54■■□□□ 1.2
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