RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498134.1

TOMM22P3-201, Transcript of TOMM22 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene TOMM22P3, Length 345 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM22P3-201ENST00000498134 MSL1Q68DK7 614 aa14.97□□□□□ -0.01
TOMM22P3-201ENST00000498134 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.97□□□□□ -0.01
TOMM22P3-201ENST00000498134 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.97□□□□□ -0.01
TOMM22P3-201ENST00000498134 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.97□□□□□ -0.01
TOMM22P3-201ENST00000498134 COPRSQ9NQ92 184 aa14.97□□□□□ -0.01
TOMM22P3-201ENST00000498134 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.97□□□□□ -0.01
TOMM22P3-201ENST00000498134 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOMM22P3-201ENST00000498134 LRP5O75197 1615 aa14.95□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 ST5P78524 1137 aa14.95□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 FAM161AQ3B820 660 aa14.95□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.95□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 GREM2Q9H772 168 aa14.95□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 MYH3P11055 1940 aa14.95□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.94□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.94□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 GCC1Q96CN9 775 aa14.94□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 NLRP3Q96P20 1036 aa14.94□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.93□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 SOCS7O14512 581 aa14.93□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 PTGER2P43116 358 aa14.93□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 FBXO3Q9UK99 471 aa14.93□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 ZBTB7AO95365 584 aa14.92□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 ITGA6P23229 1130 aa14.92□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.92□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 COL4A1P02462 1669 aa14.91□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.91□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 CIAO1O76071 339 aa14.91□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.91□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.9□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 RAB11FIP3O75154 756 aa14.9□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 PDE6BP35913 854 aa14.9□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.9□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.9□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.9□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.9□□□□□ -0.02
TOMM22P3-201ENST00000498134 EYA2O00167 538 aa14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 SRGNP10124 158 aa14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 NUCB1Q02818 461 aa14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.89□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 NPHP1O15259 732 aa14.88□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 SASH1O94885 1247 aa14.88□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 POLD1P28340 1107 aa14.88□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.87□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.87□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 NPR1P16066 1061 aa14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 GRAPQ13588 217 aa14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 LRRC24Q50LG9 513 aa14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.86□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 STYK1Q6J9G0 422 aa14.85□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.85□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.85□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 MASTLQ96GX5 879 aa14.85□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.85□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 SPON1Q9HCB6 807 aa14.85□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 BBOX1O75936 387 aa14.84□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 TGFB2P61812 414 aa14.84□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.84□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 SIL1Q9H173 461 aa14.84□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 GPR108Q9NPR9 543 aa14.84□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.84□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.84□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.83□□□□□ -0.03
TOMM22P3-201ENST00000498134 KCNA3P22001 575 aa14.83□□□□□ -0.04
TOMM22P3-201ENST00000498134 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.83□□□□□ -0.04
TOMM22P3-201ENST00000498134 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.83□□□□□ -0.04
TOMM22P3-201ENST00000498134 TMC4Q7Z404 712 aa14.83□□□□□ -0.04
TOMM22P3-201ENST00000498134 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.83□□□□□ -0.04
TOMM22P3-201ENST00000498134 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.83□□□□□ -0.04
TOMM22P3-201ENST00000498134 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms