RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 GDF11O95390 407 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 GMCL1Q96IK5 515 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 CSRNP1Q96S65 589 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 ELP3Q9H9T3 547 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 PHACTR2O75167 634 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 SASH3O75995 380 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 IGHA2P01877 340 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 FGD1P98174 961 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 PNMA5Q96PV4 448 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 SETDB2Q96T68 719 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 MBIPQ9NS73 344 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 TNFRSF21O75509 655 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 THBS1P07996 1170 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 FAM157BP0CG42 384 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 IRS1P35568 1242 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 MAP3K10Q02779 954 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 MRS2Q9HD23 443 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 PARP2Q9UGN5 583 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 BNIP3LO60238 219 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 TNP2Q05952 138 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 CCINQ13939 588 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 NLRP13Q86W25 1043 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 FAM161BQ96MY7 647 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 MARK1Q9P0L2 795 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 IGF1RP08069 1367 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 CD33P20138 364 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 PSMD2Q13200 908 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 XKR5Q6UX68 686 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 STRN4Q9NRL3 753 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 PHF24Q9UPV7 400 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 RARAP10276 462 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 CES1P23141 567 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 GRIN2CQ14957 1233 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 RNF19AQ9NV58 838 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 CNTN3Q9P232 1028 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 EFSO43281 561 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 EGFRP00533 1210 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 NFKB1P19838 968 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 KCNQ4P56696 695 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 SPEM2Q0P670 501 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 LAMC2Q13753 1193 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 BHMTQ93088 406 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 GSX2Q9BZM3 304 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 IGFLR1Q9H665 355 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 EREGO14944 169 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 MX2P20592 715 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 FGFR3P22607 806 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 ITGAEP38570 1179 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 NEUROD1Q13562 356 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-215ENST00000498054 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
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