RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497829.1

TFEC-209, Transcript of transcription factor EC, human

TSL 1 (best)

Gene TFEC, Length 174 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFEC-209	ENST00000497829	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	TXLNA	P40222	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	GDF10	P55107	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	EML1	O00423	815 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	FLII	Q13045	1269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	TTC9	Q92623	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	USP4	Q13107	963 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	MTFR1	Q15390	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	FAM35A	Q86V20	835 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	FOSL1	P15407	271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	SOX11	P35716	441 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	CTSW	P56202	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	MESP2	Q0VG99	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	PCSK7	Q16549	785 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TFEC-209	ENST00000497829		A6NJY4	79 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	CPB1	P15086	417 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	PLAUR	Q03405	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	DKK1	O94907	266 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	FLCN	Q8NFG4	579 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829		A6NJR5	290 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	TYRO3	Q06418	890 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	NCOA4	Q13772	614 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	ECM1	Q16610	540 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	INHBB	P09529	407 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	SKI	P12755	728 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	EPHA4	P54764	986 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	CLDN10	P78369	228 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	FAM168A	Q92567	244 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	RAD21	O60216	631 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	TSPAN15	O95858	294 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	GLMN	Q92990	594 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	ATP9B	O43861	1147 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	GTF2I	P78347	998 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	TEAD4	Q15561	434 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TFEC-209	ENST00000497829	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69

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