RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	IGSF3	O75054	1194 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	GPT	P24298	496 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	LAMB2	P55268	1798 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	REC8	O95072	547 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	APBA3	O96018	575 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP5J	P18859	108 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	APBB1	O00213	710 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	SDS	P20132	328 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	ITGA6	P23229	1130 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	AACS	Q86V21	672 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LPIN3-204	ENST00000496565	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.46	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	PROM2	Q8N271	834 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	PDE8B	O95263	885 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TM4SF1	P30408	202 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TFCP2	Q12800	502 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	SIL1	Q9H173	461 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	GREM2	Q9H772	168 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	RAD50	Q92878	1312 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	GYS1	P13807	737 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	BAG6	P46379	1132 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	LPIN2	Q92539	896 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	CHML	P26374	656 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	ST5	P78524	1137 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	HAUS7	Q99871	368 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	LRP5	O75197	1615 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A1B0GUL7	405 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58

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