RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 KIAA2012Q0VF49 1180 aa30.33■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 GRM1Q13255 1194 aa30.33■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 SAPCD2Q86UD0 394 aa30.33■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa30.32■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 CIAPIN1Q6FI81 312 aa30.32■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 MPNDQ8N594 471 aa30.32■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 HHIPL1Q96JK4 782 aa30.32■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 ANXA1P04083 346 aa30.31■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 NLRP10Q86W26 655 aa30.31■■■□□ 2.44
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SIMC1-208ENST00000495423 AOC2O75106 756 aa30.29■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 TNIP1Q15025 636 aa30.29■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 GRAPQ13588 217 aa30.28■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 COPS6Q7L5N1 327 aa30.28■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 CA12O43570 354 aa30.27■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 RIPK4P57078 832 aa30.27■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.27■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 SH3TC1Q8TE82 1336 aa30.26■■■□□ 2.44
SIMC1-208ENST00000495423 RAD17O75943 681 aa30.26■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 TCIRG1Q13488 830 aa30.26■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 FAM161AQ3B820 660 aa30.26■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 TMC4Q7Z404 712 aa30.26■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 XAGE3Q8WTP9 111 aa30.25■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 CDC37L1Q7L3B6 337 aa30.24■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 TRPM4Q8TD43 1214 aa30.24■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 YDJCA8MPS7 323 aa30.23■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 RALBP1Q15311 655 aa30.23■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 TSKSQ9UJT2 592 aa30.23■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 RGS19P49795 217 aa30.22■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 LMOD3Q0VAK6 560 aa30.22■■■□□ 2.43
SIMC1-208ENST00000495423 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
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SIMC1-208ENST00000495423 H7C1D1 291 aa30.19■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 DPF2Q92785 391 aa30.19■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 SHTN1A0MZ66 631 aa30.18■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF408Q9H9D4 720 aa30.18■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
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SIMC1-208ENST00000495423 AKAP11Q9UKA4 1901 aa30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 SCN9AQ15858 1988 aa30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 COL4A1P02462 1669 aa30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 SLC34A2O95436 690 aa30.16■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 NOGQ13253 232 aa30.16■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 CHL1O00533 1208 aa30.15■■■□□ 2.42
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SIMC1-208ENST00000495423 PLBD2Q8NHP8 589 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 MCOLN1Q9GZU1 580 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-208ENST00000495423 PSMD14O00487 310 aa30.13■■■□□ 2.41
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SIMC1-208ENST00000495423 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa30.12■■■□□ 2.41
SIMC1-208ENST00000495423 HUNKP57058 714 aa30.12■■■□□ 2.41
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SIMC1-208ENST00000495423 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
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SIMC1-208ENST00000495423 DBNDD1Q9H9R9 158 aa30.11■■■□□ 2.41
SIMC1-208ENST00000495423 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
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SIMC1-208ENST00000495423 RPS12P25398 132 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
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SIMC1-208ENST00000495423 ZIC5Q96T25 663 aa30.1■■■□□ 2.41
SIMC1-208ENST00000495423 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
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SIMC1-208ENST00000495423 DLK2Q6UY11 383 aa30.08■■■□□ 2.41
SIMC1-208ENST00000495423 KRT26Q7Z3Y9 468 aa30.08■■■□□ 2.41
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF428Q96B54 188 aa30.08■■■□□ 2.41
SIMC1-208ENST00000495423 RTL9Q8NET4 1388 aa30.07■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 GPSM2P81274 684 aa30.07■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM35Q9UPQ4 493 aa30.07■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 C6orf229H3BNL8 230 aa30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 RIMBP2O15034 1052 aa30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 ECE2O60344 883 aa30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 DGKZQ13574 1117 aa30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 RGMBQ6NW40 437 aa30.06■■■□□ 2.4
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