RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 GLTPD2A6NH11 291 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-214ENST00000490425 BBOX1O75936 387 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-214ENST00000490425 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
NISCH-214ENST00000490425 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
NISCH-214ENST00000490425 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NISCH-214ENST00000490425 PSMD1Q99460 953 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-214ENST00000490425 COL4A1P02462 1669 aa15.34■□□□□ 0.05
NISCH-214ENST00000490425 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
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NISCH-214ENST00000490425 GCKRQ14397 625 aa15.32■□□□□ 0.04
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NISCH-214ENST00000490425 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.31■□□□□ 0.04
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NISCH-214ENST00000490425 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.3■□□□□ 0.04
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NISCH-214ENST00000490425 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
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NISCH-214ENST00000490425 JDP2Q8WYK2 163 aa15.29■□□□□ 0.04
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NISCH-214ENST00000490425 SLC4A10Q6U841 1118 aa15.28■□□□□ 0.04
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NISCH-214ENST00000490425 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
NISCH-214ENST00000490425 GREM2Q9H772 168 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-214ENST00000490425 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.26■□□□□ 0.03
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NISCH-214ENST00000490425 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.26■□□□□ 0.03
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NISCH-214ENST00000490425 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 FAM161AQ3B820 660 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.24■□□□□ 0.03
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NISCH-214ENST00000490425 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 PTPRCP08575 1304 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 GRM8O00222 908 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 RIMBP2O15034 1052 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 ALDH1L1O75891 902 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
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NISCH-214ENST00000490425 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 RTL9Q8NET4 1388 aa15.23■□□□□ 0.03
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NISCH-214ENST00000490425 WASHC4Q2M389 1173 aa15.22■□□□□ 0.03
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NISCH-214ENST00000490425 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.22■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa15.22■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.22■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 SPEF2Q9C093 1822 aa15.22■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 LTBP1Q14766 1721 aa15.21■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 UFL1O94874 794 aa15.21■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 POTEIP0CG38 1075 aa15.21■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 POTEJP0CG39 1038 aa15.21■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 ITGA6P23229 1130 aa15.21■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 FOXO4P98177 505 aa15.21■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.21■□□□□ 0.03
NISCH-214ENST00000490425 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.2■□□□□ 0.02
NISCH-214ENST00000490425 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
NISCH-214ENST00000490425 YDJCA8MPS7 323 aa15.2■□□□□ 0.02
NISCH-214ENST00000490425 RAD17O75943 681 aa15.2■□□□□ 0.02
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