RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.02□□□□□ -1.29
SENP6-210ENST00000487548 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
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SENP6-210ENST00000487548 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.01□□□□□ -1.29
SENP6-210ENST00000487548 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.01□□□□□ -1.29
SENP6-210ENST00000487548 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.01□□□□□ -1.29
SENP6-210ENST00000487548 IFT43Q96FT9 208 aa7.01□□□□□ -1.29
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SENP6-210ENST00000487548 USP17L24Q0WX57 530 aa6.92□□□□□ -1.3
SENP6-210ENST00000487548 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.92□□□□□ -1.3
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SENP6-210ENST00000487548 MMP20O60882 483 aa6.91□□□□□ -1.3
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SENP6-210ENST00000487548 SETDB1Q15047 1291 aa6.9□□□□□ -1.3
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SENP6-210ENST00000487548 RAXQ9Y2V3 346 aa6.9□□□□□ -1.3
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SENP6-210ENST00000487548 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.89□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.89□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.89□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 LINC01387J3KSC0 135 aa6.88□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 COBLO75128 1261 aa6.88□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 IGLV1-40P01703 118 aa6.88□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 ACAD11Q709F0 780 aa6.88□□□□□ -1.31
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