RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 KRT85P78386 507 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 HOMER1Q86YM7 354 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 SKILP12757 684 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WWV3 80 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 CNTROBQ8N137 903 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 USP16Q9Y5T5 823 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 USP27XA6NNY8 438 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 NWD1Q149M9 1564 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 RASEFQ8IZ41 740 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 PI4K2BQ8TCG2 481 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA32Q96LK8 384 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 ADCY9O60503 1353 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 LARGE1O95461 756 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 BOLA2Q9H3K6 86 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 PXDNQ92626 1479 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 SUCLG2Q96I99 432 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 RAB11FIP3O75154 756 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF75DP51815 510 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 ANAPC15P60006 121 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 PDRG1Q9NUG6 133 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 NEK11Q8NG66 645 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 MYD88Q99836 296 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 STAP2Q9UGK3 403 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 MRVI1Q9Y6F6 885 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 PPFIA3O75145 1194 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 KSR2Q6VAB6 950 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 RUFY3Q7L099 469 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 TTC6Q86TZ1 520 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 POLA2Q14181 598 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC144BQ3MJ40 725 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 COPS6Q7L5N1 327 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 ATF3P18847 181 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 SNX14Q9Y5W7 946 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 PTH1RQ03431 593 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 TEX35Q5T0J7 233 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 SGSM2O43147 1006 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 GRM8O00222 908 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf67Q8IYJ2 551 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 FAM227BQ96M60 508 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 MTMR6Q9Y217 621 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC69A6NI79 296 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 SLU7O95391 586 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 DDX11Q96FC9 970 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF790Q6PG37 636 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 TATP17735 454 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 ADCK5Q3MIX3 580 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 CDC37L1Q7L3B6 337 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 MNS1Q8NEH6 495 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 ECHDC1Q9NTX5 307 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 RGPD2P0DJD1 1756 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 H3BQV1 296 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 IFFO2Q5TF58 517 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 LTN1O94822 1766 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 HSPA4P34932 840 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 SYT10Q6XYQ8 523 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 HSPA2P54652 639 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 FSD1Q9BTV5 496 aa19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms