RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482183.1

CAPN8-208, Transcript of calpain 8, human

TSL 2

Gene CAPN8, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPN8-208	ENST00000482183	SYT1	P21579	422 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	BRINP3	Q76B58	766 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	TERF1	P54274	439 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	EYA2	O00167	538 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	TAF5L	O75529	589 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	GJB2	P29033	226 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	FGD1	P98174	961 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	SIL1	Q9H173	461 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	CASP7	P55210	303 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	TFCP2	Q12800	502 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CAPN8-208	ENST00000482183	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	PTH1R	Q03431	593 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	FBXO41	Q8TF61	875 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	C5	P01031	1676 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	CCDC192	P0DO97	292 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	PKP1	Q13835	747 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	ARX	Q96QS3	562 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	PANK2	Q9BZ23	570 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	SYCE3	A1L190	88 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183		H3BQV1	296 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	CTAGE5	O15320	804 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	TPM2	P07951	284 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	FOXO4	P98177	505 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183		A0A0D9SFI3	127 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	ME3	Q16798	604 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CAPN8-208	ENST00000482183	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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