RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 CRY2Q49AN0 593 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 POLA2Q14181 598 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 SYNE4Q8N205 404 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 FBXO3Q9UK99 471 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.22■□□□□ 0.19
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NISCH-208ENST00000481211 COPRSQ9NQ92 184 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.21■□□□□ 0.19
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NISCH-208ENST00000481211 FAM161AQ3B820 660 aa16.2■□□□□ 0.18
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NISCH-208ENST00000481211 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
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NISCH-208ENST00000481211 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.2■□□□□ 0.18
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NISCH-208ENST00000481211 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.2■□□□□ 0.18
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NISCH-208ENST00000481211 TGFB2P61812 414 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 TMC4Q7Z404 712 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 GREM2Q9H772 168 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 H0YIN7 160 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 CIAO1O76071 339 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 ALDH1B1P30837 517 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 STYK1Q6J9G0 422 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 MASTLQ96GX5 879 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 DCTPP1Q9H773 170 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 LRP5O75197 1615 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 RAB11FIP3O75154 756 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 SRGNP10124 158 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
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NISCH-208ENST00000481211 ERC1Q8IUD2 1116 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 BBOX1O75936 387 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 GRAPQ13588 217 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 EYA2O00167 538 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 SMC5Q8IY18 1101 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 CNKSR1Q969H4 720 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 MPHOSPH8Q99549 860 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-208ENST00000481211 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 IGHDP01880 384 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.12■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 KIF1BPQ96EK5 621 aa16.12■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 ATG9AQ7Z3C6 839 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 POTEDQ86YR6 584 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 GPR108Q9NPR9 543 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-208ENST00000481211 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
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