RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479535.2

SYCE1-205, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SYCE1, Length 2,479 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-205ENST00000479535 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYCE1-205ENST00000479535 LRRC24Q50LG9 513 aa16.09■□□□□ 0.17
SYCE1-205ENST00000479535 ISCA1Q9BUE6 129 aa16.09■□□□□ 0.17
SYCE1-205ENST00000479535 ATG3Q9NT62 314 aa16.09■□□□□ 0.17
SYCE1-205ENST00000479535 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYCE1-205ENST00000479535 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SYCE1-205ENST00000479535 TAF5LO75529 589 aa16.08■□□□□ 0.17
SYCE1-205ENST00000479535 TIMM10P62072 90 aa16.08■□□□□ 0.17
SYCE1-205ENST00000479535 TCIRG1Q13488 830 aa16.08■□□□□ 0.17
SYCE1-205ENST00000479535 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.08■□□□□ 0.17
SYCE1-205ENST00000479535 JCADQ9P266 1359 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 DTNBO60941 627 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF445P59923 1031 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC83Q8IWF9 413 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF609O15014 1411 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 EYA2O00167 538 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 RNF20Q5VTR2 975 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 SYT1P21579 422 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 PSMA5P28066 241 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 ST3GAL1Q11201 340 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 ME3Q16798 604 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 GPR108Q9NPR9 543 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 TCEANC2Q96MN5 208 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 DISP2A7MBM2 1401 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 STX6O43752 255 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 STARD3NLO95772 234 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 NECAB1Q8N987 351 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 KBTBD3Q8NAB2 608 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 FAM89AQ96GI7 184 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 GOLIM4O00461 696 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 CIAO1O76071 339 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 GJB2P29033 226 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 A0A1B0GUL7 405 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 RPS6KB1P23443 525 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 SLFNL1Q499Z3 407 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 MBD3O95983 291 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 TSGA10IPQ3SY00 556 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 BCL9O00512 1426 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 HLFQ16534 295 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 NASPP49321 788 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 USP48Q86UV5 1035 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-205ENST00000479535 ITGB4P16144 1822 aa16.02■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 PALLDQ8WX93 1383 aa16.02■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 SYNE4Q8N205 404 aa16.02■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 F13A1P00488 732 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 SH3TC1Q8TE82 1336 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 SYCE3A1L190 88 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 EXOC5O00471 708 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 GPTP24298 496 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 CEP126Q9P2H0 1117 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 CYP21A2P08686 494 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 ANKRD1Q15327 319 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 RBSNQ9H1K0 784 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 MTMR6Q9Y217 621 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 CSF1RP07333 972 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 KRT32Q14532 448 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms