RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478911.1

SUPT20H-215, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, humanhuman

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 591 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20H-215ENST00000478911 ZBTB39O15060 712 aa5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 DYRK3O43781 588 aa5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 MAPK1P28482 360 aa5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 NBPF11Q86T75 865 aa5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 KLF15Q9UIH9 416 aa5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 BCS1LQ9Y276 419 aa5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 CD33P20138 364 aa5.8□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.8□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 NLRP8Q86W28 1048 aa5.8□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 IFT43Q96FT9 208 aa5.8□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 BTBD11A6QL63 1104 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 FZD6O60353 706 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 APBA3O96018 575 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 ERCC3P19447 782 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 HIF1AQ16665 826 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM182BQ5T319 152 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 ATCAYQ86WG3 371 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 SUSD3Q96L08 255 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 ASB16Q96NS5 453 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 ZIC5Q96T25 663 aa5.79□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 NDUFB5O43674 189 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 ZAP70P43403 619 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 TNP2Q05952 138 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 IER5Q5VY09 327 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 TREML1Q86YW5 311 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF280CQ8ND82 737 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.78□□□□□ -1.48
SUPT20H-215ENST00000478911 A0A1W2PNR3 127 aa5.77□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 AAMPQ13685 434 aa5.77□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.77□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 RGL4Q8IZJ4 473 aa5.77□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 HCN2Q9UL51 889 aa5.77□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.77□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa5.77□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 MICAL2O94851 1124 aa5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 TMC7Q7Z402 723 aa5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 EDEM1Q92611 657 aa5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 CITED4Q96RK1 184 aa5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa5.76□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 IGHA2P01877 340 aa5.75□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 PDGFAP04085 211 aa5.75□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 IDH3AP50213 366 aa5.75□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.75□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM129BQ96TA1 746 aa5.75□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.75□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 POLIQ9UNA4 740 aa5.75□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM229AH3BQW9 127 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 OPLAHO14841 1288 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM157BP0CG42 384 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ALAS2P22557 587 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 INPP5BP32019 993 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 LRP8Q14114 963 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 GJD3Q8N144 294 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ELOA3Q8NG57 546 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 GPR152Q8TDT2 470 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF428Q96B54 188 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 NACC1Q96RE7 527 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.74□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 GPR182O15218 404 aa5.73□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 TREHO43280 583 aa5.73□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 USP5P45974 858 aa5.73□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 ARSDP51689 593 aa5.73□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 TYRO3Q06418 890 aa5.73□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 PDE3BQ13370 1112 aa5.73□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 COL19A1Q14993 1142 aa5.73□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.73□□□□□ -1.49
SUPT20H-215ENST00000478911 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms