RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 RTL9Q8NET4 1388 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 DPEP1P16444 411 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 KLHL34Q8N239 644 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 SYT17Q9BSW7 474 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 COL4A1P02462 1669 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 CRBNQ96SW2 442 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 A0A0G2JLW4 131 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 H0YIN7 160 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 GNAI2P04899 355 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 NPR1P16066 1061 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 STYK1Q6J9G0 422 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 GREM2Q9H772 168 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 FAM161AQ3B820 660 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 MASTLQ96GX5 879 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 MTX1Q13505 466 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 TAF1P21675 1872 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 SLX4Q8IY92 1834 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 ITGA6P23229 1130 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 GRAPQ13588 217 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 CNKSR1Q969H4 720 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 PIM2Q9P1W9 311 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-210ENST00000477812 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 CEP85Q6P2H3 762 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 TTLL6Q8N841 843 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 ALDH1B1P30837 517 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 CACNA1SQ13698 1873 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 ATP8B2P98198 1209 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 SLC51AQ86UW1 340 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 SRGAP3O43295 1099 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 BBOX1O75936 387 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 AAMPQ13685 434 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 POLA2Q14181 598 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 SNED1Q8TER0 1413 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 SSH3Q8TE77 659 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 SPEF2Q9C093 1822 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTB-210ENST00000477812 TMC4Q7Z404 712 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 COPRSQ9NQ92 184 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 LTBP1Q14766 1721 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.572e-79■□□□□ 9.9
ACTB-210ENST00000477812 OLFM4Q6UX06 510 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 BCS1LQ9Y276 419 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 SP8Q8IXZ3 490 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 A0A1B0GUL6 1792 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 C21orf2O43822 256 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-210ENST00000477812 CIAO1O76071 339 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 LRRC24Q50LG9 513 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms