RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 TTLL11Q8NHH1 800 aa5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 POLLQ9UGP5 575 aa5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 PDE8AO60658 829 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 CSF1RP07333 972 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 GPSM2P81274 684 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 FOXO4P98177 505 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 CXCL9Q07325 125 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 GCKRQ14397 625 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 AOC3Q16853 763 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 BEND3Q5T5X7 828 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 DPY19L2Q6NUT2 758 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 LINS1Q8NG48 757 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 DNAAF4Q8WXU2 420 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 KAZALD1Q96I82 304 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 STK31Q9BXU1 1019 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 SHTN1A0MZ66 631 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 E9PSI1 815 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 SNAP23O00161 211 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 DDX58O95786 925 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 EPS15P42566 896 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 SCNN1DP51172 638 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 CTSWP56202 376 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 LARGE2Q8N3Y3 721 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 MPNDQ8N594 471 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 GREM2Q9H772 168 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 CACNA1SQ13698 1873 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 RIMBP2O15034 1052 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 PPIP5K2O43314 1243 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 RAD17O75943 681 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 FSTL1Q12841 308 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 GRIPAP1Q4V328 841 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 GPC2Q8N158 579 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 TBC1D16Q8TBP0 767 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 VPS33BQ9H267 617 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 PODXL2Q9NZ53 605 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2Q1-204ENST00000476612 TAF1P21675 1872 aa5.09□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 DUOX1Q9NRD9 1551 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 PSMD14O00487 310 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 EGFRP00533 1210 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 ITGA6P23229 1130 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 KLRK1P26718 216 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 EPHX2P34913 555 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 DOK7Q18PE1 504 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 WASHC4Q2M389 1173 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC152Q4G0S7 254 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 DLK2Q6UY11 383 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 TMC4Q7Z404 712 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 JDP2Q8WYK2 163 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 SUCLG2Q96I99 432 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 HACL1Q9UJ83 578 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 TNNQ9UQP3 1299 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa5.07□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 RTL9Q8NET4 1388 aa5.07□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 LAMB2P55268 1798 aa5.07□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 UTYO14607 1347 aa5.07□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 PASKQ96RG2 1323 aa5.07□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.07□□□□□ -1.6
UBE2Q1-204ENST00000476612 WDR90Q96KV7 1748 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.2 ms