RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 EYA2O00167 538 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 GPR108Q9NPR9 543 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 ST18O60284 1047 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 IL17RAQ96F46 866 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 SBF2Q86WG5 1849 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 MYH3P11055 1940 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 BCORQ6W2J9 1755 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 PARP10Q53GL7 1025 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 EVI5LQ96CN4 794 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 AK7Q96M32 723 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 FSD2A1L4K1 749 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 PDE8AO60658 829 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 CTSWP56202 376 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 ANAPC15P60006 121 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 FAM182BQ5T319 152 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 SYNE4Q8N205 404 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 LY75O60449 1722 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 RGL2O15211 777 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 ATP5JP18859 108 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 NUCB2P80303 420 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 LRRC24Q50LG9 513 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 MCM2P49736 904 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 MCCP23508 829 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 SUSD4Q5VX71 490 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 ZNF609O15014 1411 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 HIP1O00291 1037 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 SGSM2O43147 1006 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 RPS6KA4O75676 772 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 ITGA6P23229 1130 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 KCNQ4P56696 695 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 GREM2Q9H772 168 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-204ENST00000476231 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 SCN7AQ01118 1682 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 LAMB2P55268 1798 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 NEUROD6Q96NK8 337 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 NTSR2O95665 410 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 IL25Q9H293 177 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 HAUS7Q99871 368 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 A0A1B0GUL7 405 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 TIMM10P62072 90 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 FSD1Q9BTV5 496 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 NARFQ9UHQ1 456 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 RAD50Q92878 1312 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 LRP5O75197 1615 aa22.97■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 FAM177BA6PVY3 158 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 GNPATO15228 680 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 SSFA2P28290 1259 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.96■■□□□ 1.27
SYF2-204ENST00000476231 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.3 ms