RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 PDE8AO60658 829 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 SASH1O94885 1247 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 CSF1RP07333 972 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 ABCC12Q96J65 1359 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC24Q50LG9 513 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 ITGA6P23229 1130 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 DDR1Q08345 913 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 NPHP1O15259 732 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 TM4SF1P30408 202 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 COPRSQ9NQ92 184 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 STK32BQ9NY57 414 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 TFCP2Q12800 502 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 SERPINB2P05120 415 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 COL4A1P02462 1669 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 RAB11FIP3O75154 756 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.162e-8■■■■□ 23.4
ATG4B-217ENST00000475693 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 RGL2O15211 777 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 SLC51AQ86UW1 340 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 CNBD1Q8NA66 436 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 NYXQ9GZU5 481 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 TAF1P21675 1872 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 MYH3P11055 1940 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 EYA2O00167 538 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 MMP10P09238 476 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 AACSQ86V21 672 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-217ENST00000475693 SNAP23O00161 211 aa22.26■■□□□ 1.15
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ATG4B-217ENST00000475693 CCDC125Q86Z20 511 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 NLRP3Q96P20 1036 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 PDE1AP54750 535 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 TIMM10P62072 90 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 ILDR2Q71H61 639 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 MX1P20591 662 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 TNNI3KQ59H18 835 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 TAF5LO75529 589 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 C8orf34Q49A92 452 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 LAMB2P55268 1798 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 CASZ1Q86V15 1759 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 METTL24Q5JXM2 366 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 TTC22Q5TAA0 569 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-217ENST00000475693 UTRNP46939 3433 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 CIAO1O76071 339 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 ST5P78524 1137 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-217ENST00000475693 ZBTB7AO95365 584 aa22.19■■□□□ 1.14
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