RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470815.1

HERC3-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-208ENST00000470815 RASA1P20936 1047 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 IGFBP4P22692 258 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 PTK7Q13308 1070 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 GRIK5Q16478 980 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 FAM35AQ86V20 835 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 BCS1LQ9Y276 419 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 ATG7O95352 703 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 INPP5BP32019 993 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L15C9J2P7 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L10C9JJH3 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L12C9JPN9 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L11C9JVI0 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L21D6R901 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L18D6R9N7 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L22D6RA61 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L19D6RCP7 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L20D6RJB6 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 GPLD1P80108 840 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 USP17L24Q0WX57 530 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 CPB1P15086 417 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 IDH3AP50213 366 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 ARSDP51689 593 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 PERM1Q5SV97 790 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 ARXQ96QS3 562 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 RNF112Q9ULX5 631 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 RFX1P22670 979 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 NOS3P29474 1203 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 HINFPQ9BQA5 517 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 ZFATQ9P243 1243 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 NRLP54845 237 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 DPYDQ12882 1025 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 SLC51AQ86UW1 340 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-208ENST00000470815 FOXO3O43524 673 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 LCE3BQ5TA77 95 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 IFT43Q96FT9 208 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 MYO19Q96H55 970 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 KLK14Q9P0G3 267 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 DLL1O00548 723 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 EGFRP00533 1210 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 RARAP10276 462 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 DGKZQ13574 1117 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 MICAL2O94851 1124 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 PLAURQ03405 335 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 CDCA8Q53HL2 280 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 WEE1P30291 646 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 SASH3O75995 380 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 SOX18P35713 384 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 Q6ZS46 218 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 STK32AQ8WU08 396 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.346e-6■■■■■ 48.1
HERC3-208ENST00000470815 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC3-208ENST00000470815 F8W735 103 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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