RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTB-208ENST00000464611 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTB-208ENST00000464611 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTB-208ENST00000464611 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTB-208ENST00000464611 FAM184AQ8NB25 1140 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTB-208ENST00000464611 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTB-208ENST00000464611 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
ACTB-208ENST00000464611 HMG20BQ9P0W2 317 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTB-208ENST00000464611 PHKG2P15735 406 aa10.21□□□□□ -0.77
ACTB-208ENST00000464611 PDCP20941 246 aa10.21□□□□□ -0.77
ACTB-208ENST00000464611 KRT32Q14532 448 aa10.21□□□□□ -0.77
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ACTB-208ENST00000464611 PALD1Q9ULE6 856 aa10.19□□□□□ -0.78
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ACTB-208ENST00000464611 NEURL1BA8MQ27 555 aa10.18□□□□□ -0.78
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ACTB-208ENST00000464611 ATP5JP18859 108 aa10.18□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 TERF1P54274 439 aa10.18□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 PDIA6Q15084 440 aa10.18□□□□□ -0.78
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ACTB-208ENST00000464611 RUFY3Q7L099 469 aa10.18□□□□□ -0.78
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ACTB-208ENST00000464611 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 SLC39A7Q92504 469 aa10.17□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 SUCLG2Q96I99 432 aa10.17□□□□□ -0.78
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ACTB-208ENST00000464611 CYP27B1O15528 508 aa10.16□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 SASH1O94885 1247 aa10.16□□□□□ -0.78
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ACTB-208ENST00000464611 AK2P54819 239 aa10.16□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 CABP4P57796 275 aa10.16□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 UBE2HP62256 183 aa10.16□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 COPS6Q7L5N1 327 aa10.16□□□□□ -0.78
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ACTB-208ENST00000464611 GPT2Q8TD30 523 aa10.16□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
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ACTB-208ENST00000464611 PAPPAQ13219 1627 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 ITGB4P16144 1822 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 IGKV5-2P06315 115 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 CASTP20810 708 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 PKP1Q13835 747 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
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