RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM5Q9C035 493 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 UNCXA6NJT0 531 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 CLGNO14967 610 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 ERO1AQ96HE7 468 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 DCTPP1Q9H773 170 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 POLKQ9UBT6 870 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 RGPD5Q99666 1765 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 FOSBP53539 338 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 RETREG2Q8NC44 543 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 SBF2Q86WG5 1849 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 ERBB3P21860 1342 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO1CO00159 1063 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 APPP05067 770 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN14Q15678 1187 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 TOMM22Q9NS69 142 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 PSEN1P49768 467 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP14P50281 582 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 BARGINQ6ZT62 677 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 DTNBO60941 627 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G4AP47712 749 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 ST5P78524 1137 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMK4Q16566 473 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX35Q5T0J7 233 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-203ENST00000439720 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR29P0C7W0 189 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCN6P51797 869 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 ICE2Q659A1 982 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRCP08575 1304 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 RGS12O14924 1447 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 CASQ1P31415 396 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF75DP51815 510 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 ARID5BQ14865 1188 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0232Q92628 1395 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 CRB1P82279 1406 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX14O75381 377 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 SMARCE1Q969G3 411 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 NGLY1Q96IV0 654 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 PPME1Q9Y570 386 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 TYRO3Q06418 890 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPYL6Q8N831 410 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.839e-7■□□□□ 10.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 CABP1Q9NZU7 370 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSCAN26Q16670 478 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 CBX8Q9HC52 389 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 AFF2P51816 1311 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCC4O15439 1325 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 STX6O43752 255 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 F13A1P00488 732 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 SYT1P21579 422 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP3K11Q16584 847 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.9 ms