RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 CHMP4BP1P59074 171 aa6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 CENPCQ03188 943 aa6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 NPHS2Q9NP85 383 aa6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 SNTG2Q9NY99 539 aa6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 BCS1LQ9Y276 419 aa6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.49□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 PHACTR2O75167 634 aa6.49□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 ADH1CP00326 375 aa6.49□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 GSTT1P30711 240 aa6.49□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX9P48436 509 aa6.49□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.49□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.49□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC45O75419 566 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 ADH1AP07327 375 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 RASA3Q14644 834 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 PSMD1Q99460 953 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 GINM1Q9NU53 330 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 RLBP1P12271 317 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 TXLNAP40222 546 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM74Q96NL1 305 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 NLRP3Q96P20 1036 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 IDH3AP50213 366 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ARSHQ5FYA8 562 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 IER5Q5VY09 327 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 APPBP2Q92624 585 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ELP3Q9H9T3 547 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 FANCLQ9NW38 375 aa6.46□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 RPIAP49247 311 aa6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ARSDP51689 593 aa6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 CBLBQ13191 982 aa6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 GRM2Q14416 872 aa6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 HOMER1Q86YM7 354 aa6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 MEN1O00255 615 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 SIAH2O43255 324 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 NR3C2P08235 984 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 PTGIRP43119 386 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 PMEPA1Q969W9 287 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.44□□□□□ -1.38
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