RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 CASC1Q6TDU7 716 aa20.15■□□□□ 0.82
CNGA3-205ENST00000436404 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNGA3-205ENST00000436404 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNGA3-205ENST00000436404 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CNGA3-205ENST00000436404 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CNGA3-205ENST00000436404 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CNGA3-205ENST00000436404 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CNGA3-205ENST00000436404 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
CNGA3-205ENST00000436404 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.14■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.14■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.13■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 ITPK1Q13572 414 aa20.13■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.13■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.12■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 REC8O95072 547 aa20.12■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.12■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.12■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 COPS6Q7L5N1 327 aa20.12■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 TMX3Q96JJ7 454 aa20.12■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.12■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 ATP6V1AP38606 617 aa20.11■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 TPM3P06753 285 aa20.11■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 MCM2P49736 904 aa20.11■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.11■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 KDM4AO75164 1064 aa20.1■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 STARD3NLO95772 234 aa20.1■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 SYCP1Q15431 976 aa20.1■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 KSR2Q6VAB6 950 aa20.1■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 DCTPP1Q9H773 170 aa20.1■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.09■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 CUL4AQ13619 759 aa20.09■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 ATP10DQ9P241 1426 aa20.09■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.09■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.09■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 SDSP20132 328 aa20.08■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 KCNQ4P56696 695 aa20.08■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.08■□□□□ 0.81
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM37O94972 964 aa20.08■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 BEND3Q5T5X7 828 aa20.07■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.07■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 USP48Q86UV5 1035 aa20.07■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 NEK4P51957 841 aa20.07■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.07■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 SLFN14P0C7P3 912 aa20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 ERC2O15083 957 aa20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.05■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 MEIS3Q99687 375 aa20.05■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.05■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 MX1P20591 662 aa20.05■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 KLHL34Q8N239 644 aa20.05■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC66A2RUB6 948 aa20.04■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 ZBTB22O15209 634 aa20.04■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.04■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.04■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.04■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 VGLL3A8MV65 326 aa20.03■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.03■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.03■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.03■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.02■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CNGA3-205ENST00000436404 IGKV5-2P06315 115 aa20.02■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 USP44Q9H0E7 712 aa20.02■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 C4BP0C0L5 1744 aa20.01■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.01■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 NUP98P52948 1817 aa20.01■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 KCNJ4P48050 445 aa20.01■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 LINS1Q8NG48 757 aa20■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 PLCB2Q00722 1185 aa20■□□□□ 0.79
CNGA3-205ENST00000436404 TERF2Q15554 542 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms