RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP5JP18859 108 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-202ENST00000435136 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.56■■□□□ 1.2
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SH3BP2-202ENST00000435136 GBP4Q96PP9 640 aa22.56■■□□□ 1.2
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SH3BP2-202ENST00000435136 PALD1Q9ULE6 856 aa22.54■■□□□ 1.2
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SH3BP2-202ENST00000435136 MAP4K1Q92918 833 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.45■■□□□ 1.18
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SH3BP2-202ENST00000435136 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 PALLDQ8WX93 1383 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 NECTIN1Q15223 517 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC14Q96N46 770 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 AK7Q96M32 723 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 SSFA2P28290 1259 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 PTH1RQ03431 593 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAK2O60296 914 aa22.41■■□□□ 1.18
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SH3BP2-202ENST00000435136 FAM227BQ96M60 508 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF20Q5VTR2 975 aa22.41■■□□□ 1.18
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SH3BP2-202ENST00000435136 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.41■■□□□ 1.18
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SH3BP2-202ENST00000435136 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.4■■□□□ 1.18
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SH3BP2-202ENST00000435136 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2-202ENST00000435136 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 VPS53Q5VIR6 699 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 LRP5O75197 1615 aa22.39■■□□□ 1.17
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