RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 KLHL34Q8N239 644 aa25.63■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 NPR1P16066 1061 aa25.62■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 DPEP1P16444 411 aa25.62■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 CHRNA5P30532 468 aa25.62■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 STYK1Q6J9G0 422 aa25.62■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.62■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 MASTLQ96GX5 879 aa25.62■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.61■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 A0A0G2JLW4 131 aa25.6■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.6■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 MYH3P11055 1940 aa25.6■■□□□ 1.69
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TSTA3-201ENST00000425753 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.59■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.59■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
TSTA3-201ENST00000425753 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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TSTA3-201ENST00000425753 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.57■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 CNKSR1Q969H4 720 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 ALDH1B1P30837 517 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 MTX1Q13505 466 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 GREM2Q9H772 168 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 PIM2Q9P1W9 311 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 FAM161AQ3B820 660 aa25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 GRAPQ13588 217 aa25.54■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 TTLL6Q8N841 843 aa25.54■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.682e-6■■■■□ 20.7
TSTA3-201ENST00000425753 COL4A1P02462 1669 aa25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 ITGA6P23229 1130 aa25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 CRBNQ96SW2 442 aa25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-201ENST00000425753 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 BBOX1O75936 387 aa25.5■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 AAMPQ13685 434 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 TMC4Q7Z404 712 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.48■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.48■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.48■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 CEP85Q6P2H3 762 aa25.47■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 SLX4Q8IY92 1834 aa25.47■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 SNED1Q8TER0 1413 aa25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.45■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.45■■□□□ 1.67
TSTA3-201ENST00000425753 SRGAP3O43295 1099 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 ATP8B2P98198 1209 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 SSH3Q8TE77 659 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 BCS1LQ9Y276 419 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 UTRNP46939 3433 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 POLA2Q14181 598 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 SP8Q8IXZ3 490 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 TAF1P21675 1872 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 SOGA3Q5TF21 947 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 COPRSQ9NQ92 184 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 CACNA1SQ13698 1873 aa25.42■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.662e-7■■■□□ 17
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TSTA3-201ENST00000425753 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.42■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.41■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 C21orf2O43822 256 aa25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC93Q567U6 631 aa25.39■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 LTBP1Q14766 1721 aa25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 SLC51AQ86UW1 340 aa25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 CIAO1O76071 339 aa25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.37■■□□□ 1.65
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