RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP3Q96P20 1036 aa21.04■□□□□ 0.96
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
TOP3BP1-201ENST00000420768 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
TOP3BP1-201ENST00000420768 COPRSQ9NQ92 184 aa21.03■□□□□ 0.96
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
TOP3BP1-201ENST00000420768 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
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TOP3BP1-201ENST00000420768 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.99■□□□□ 0.95
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTFR1LQ9H019 292 aa20.99■□□□□ 0.95
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.92■□□□□ 0.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.92■□□□□ 0.94
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.91■□□□□ 0.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC24Q50LG9 513 aa20.9■□□□□ 0.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 LNPKQ9C0E8 428 aa20.9■□□□□ 0.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.9■□□□□ 0.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.89■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.88■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRP5O75197 1615 aa20.88■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.88■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.87■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR108Q9NPR9 543 aa20.87■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALDH1B1P30837 517 aa20.86■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 MASTLQ96GX5 879 aa20.86■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.86■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 BBOX1O75936 387 aa20.85■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL24Q5JXM2 366 aa20.85■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMC4Q7Z404 712 aa20.85■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.85■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.85■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDE4AP27815 886 aa20.85■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTGER2P43116 358 aa20.85■□□□□ 0.93
TOP3BP1-201ENST00000420768 STYK1Q6J9G0 422 aa20.85■□□□□ 0.93
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