RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 PRR5LQ6MZQ0 368 aa12.35□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 CNBD1Q8NA66 436 aa12.35□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 RIC1Q4ADV7 1423 aa12.35□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 POLA2Q14181 598 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 LMBR1LQ6UX01 489 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 SSH3Q8TE77 659 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCDC136Q96JN2 1154 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 MYH3P11055 1940 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 SRGAP3O43295 1099 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 IGHDP01880 384 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 CTSWP56202 376 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 TTLL11Q8NHH1 800 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 MTFR1LQ9H019 292 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.34□□□□□ -0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 HMMRO75330 724 aa12.33□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.32□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 NPHP1O15259 732 aa12.32□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZBTB7AO95365 584 aa12.32□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 ST5P78524 1137 aa12.32□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.32□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCDC24Q8N4L8 307 aa12.32□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 NLRP3Q96P20 1036 aa12.32□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 RTL9Q8NET4 1388 aa12.31□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 FAM161AQ3B820 660 aa12.31□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 GREM2Q9H772 168 aa12.31□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 DCTPP1Q9H773 170 aa12.31□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 CRY2Q49AN0 593 aa12.3□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCDC152Q4G0S7 254 aa12.3□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.3□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 BRIP1Q9BX63 1249 aa12.3□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 COPRSQ9NQ92 184 aa12.3□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa12.3□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 ITGA6P23229 1130 aa12.29□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCDC57Q2TAC2 916 aa12.29□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 SMC5Q8IY18 1101 aa12.29□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 GCC1Q96CN9 775 aa12.29□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.29□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa12.29□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.28□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 C10orf71Q711Q0 1435 aa12.28□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa12.27□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 SURF6O75683 361 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 POLD1P28340 1107 aa12.27□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 PTGER2P43116 358 aa12.27□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 SEC31BQ9NQW1 1179 aa12.27□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa12.27□□□□□ -0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 LRP5O75197 1615 aa12.27□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 PDE6BP35913 854 aa12.27□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 FBXO3Q9UK99 471 aa12.27□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 COL4A1P02462 1669 aa12.26□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 SRGNP10124 158 aa12.26□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa12.26□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 KIF13BQ9NQT8 1826 aa12.25□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 EYA2O00167 538 aa12.25□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 RAB11FIP3O75154 756 aa12.25□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 CIAO1O76071 339 aa12.25□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 EVX2Q03828 476 aa12.25□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.25□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 ATG9AQ7Z3C6 839 aa12.25□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 SIL1Q9H173 461 aa12.25□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.25□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 SASH1O94885 1247 aa12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 GRAPQ13588 217 aa12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 LRRC24Q50LG9 513 aa12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 CRAMP1Q96RY5 1269 aa12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 SPON1Q9HCB6 807 aa12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa12.24□□□□□ -0.45
CD27-AS1-202ENST00000417058 TAF1P21675 1872 aa12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms