RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-206	ENST00000414253	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		29.25	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	NBPF26	B4DH59	902 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	KDM4A	O75164	1064 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	IL2RB	P14784	551 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	NBPF14	Q5TI25	921 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	MPND	Q8N594	471 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	NBPF15	Q8N660	670 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	STRN4	Q9NRL3	753 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	COPRS	Q9NQ92	184 aa		29.23	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	COL15A1	P39059	1388 aa		29.23	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		29.23	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	LARGE1	O95461	756 aa		29.22	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253		A0A087WZG4	1122 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	VPS53	Q5VIR6	699 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	CPA1	P15085	419 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	GJB2	P29033	226 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	MTMR6	Q9Y217	621 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.2	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		29.2	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.27
FAAP20-206	ENST00000414253	CASP7	P55210	303 aa		29.2	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	PTH1R	Q03431	593 aa		29.2	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		29.2	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		29.19	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		29.19	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		29.19	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		29.18	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	PAPPA	Q13219	1627 aa		29.18	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	KCNB2	Q92953	911 aa		29.18	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		29.18	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		29.17	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	HIP1	O00291	1037 aa		29.17	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	EVA1C	P58658	441 aa		29.17	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	A1BG	P04217	495 aa		29.16	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	29.16	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		29.16	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		29.16	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		29.16	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	FAM227B	Q96M60	508 aa		29.15	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		29.15	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
FAAP20-206	ENST00000414253	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		29.14	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253		H7C1W4	665 aa		29.13	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	TFCP2	Q12800	502 aa		29.13	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	TNNI3K	Q59H18	835 aa		29.13	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		29.13	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	ST3GAL1	Q11201	340 aa		29.12	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	FSD1	Q9BTV5	496 aa		29.12	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	TNS2	Q63HR2	1409 aa		29.12	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	NECTIN1	Q15223	517 aa		29.12	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		29.12	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	SNRK	Q9NRH2	765 aa		29.12	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	TPM3	P06753	285 aa		29.11	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	FOXO4	P98177	505 aa		29.11	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	PLCB2	Q00722	1185 aa		29.11	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	AP5Z1	O43299	807 aa		29.1	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	ME3	Q16798	604 aa		29.1	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	BTG4	Q9NY30	223 aa		29.1	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	CCDC192	P0DO97	292 aa		29.09	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	ATP5J	P18859	108 aa		29.09	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		29.09	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253		A0A0D9SFI3	127 aa		29.09	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	MAP4K1	Q92918	833 aa		29.09	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	TJP1	Q07157	1748 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAAP20-206	ENST00000414253	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	ARID3A	Q99856	593 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	DTNB	O60941	627 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	KRT85	P78386	507 aa		29.06	■■■□□ 2.24

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