RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OPLAHO14841 1288 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SH3BP2P78314 561 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGBP1P78318 339 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ORC1Q13415 861 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LINC01559Q495D7 138 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC9A9Q8IVB4 645 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPME1Q9Y570 386 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USP3Q9Y6I4 520 aa5.43□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A6NJY4 79 aa5.42□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USP5P45974 858 aa5.42□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PAK2Q13177 524 aa5.42□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TBCELQ5QJ74 424 aa5.42□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.42□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.42□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SERTAD1Q9UHV2 236 aa5.42□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa5.42□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EML1O00423 815 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LILRA1O75019 489 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMTNP53814 917 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AAMPQ13685 434 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NFE2L2Q16236 605 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PODNQ7Z5L7 613 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VPS37DQ86XT2 251 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EDEM1Q92611 657 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ENAMQ9NRM1 1142 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDK2AP1O14519 115 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GIPC1O14908 333 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SIAH2O43255 324 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EHBP1Q8NDI1 1231 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPRASP2Q96D09 838 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 XAGE2Q96GT9 111 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C12orf49Q9H741 205 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IFT57Q9NWB7 429 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GGT7Q9UJ14 662 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLF4O43474 513 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GNRH1P01148 92 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZAP70P43403 619 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AGERQ15109 404 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TEAD4Q15561 434 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC181Q5TID7 509 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COPRSQ9NQ92 184 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPG7Q9UQ90 795 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5.38□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRM5P41594 1212 aa5.38□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RTN1Q16799 776 aa5.38□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PI16Q6UXB8 463 aa5.38□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.38□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.38□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDK15Q96Q40 435 aa5.38□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.38□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLEKHD1A6NEE1 506 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL2RAP01589 272 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NOS2P35228 1153 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADD1P35611 737 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB15P59190 212 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RASA3Q14644 834 aa5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.3 ms