RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	ITGA6	P23229	1130 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	EYA2	O00167	538 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	PLSCR1	O15162	318 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	NPHP1	O15259	732 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	CDC45	O75419	566 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAD9B-204	ENST00000409300	TIMM10	P62072	90 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	MYH3	P11055	1940 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	MSH5	O43196	834 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	ADRA2B	P18089	450 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	ERC2	O15083	957 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	AOX1	Q06278	1338 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	CIAO1	O76071	339 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	SSFA2	P28290	1259 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	NFIX	Q14938	502 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	RGL2	O15211	777 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	GYS1	P13807	737 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300		A0A1B0GUL7	405 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	AKT1S1	Q96B36	256 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD9B-204	ENST00000409300	CHML	P26374	656 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	TAF5L	O75529	589 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	ADORA1	P30542	326 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	SNAP23	O00161	211 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	PDE8B	O95263	885 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	ATP5J	P18859	108 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAD9B-204	ENST00000409300	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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