RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395560.7

UPP1-202, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 955 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-202ENST00000395560 HMMRO75330 724 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 CSF1RP07333 972 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 SYNE4Q8N205 404 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 NLRP3Q96P20 1036 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 MYH3P11055 1940 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 CTSWP56202 376 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 SRGAP3O43295 1099 aa22.26■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.26■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 SSH3Q8TE77 659 aa22.26■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.26■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 ABCC12Q96J65 1359 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 RTL9Q8NET4 1388 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 POLA2Q14181 598 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 PDE6BP35913 854 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 C1QTNF8P60827 252 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-202ENST00000395560 CRY2Q49AN0 593 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 GCC1Q96CN9 775 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 GREM2Q9H772 168 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 FBXO3Q9UK99 471 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 ITGA6P23229 1130 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 FAM161AQ3B820 660 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 DCTPP1Q9H773 170 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 COPRSQ9NQ92 184 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 IGHDP01880 384 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 H0YIN7 160 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 RAB11FIP3O75154 756 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 SMC5Q8IY18 1101 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-202ENST00000395560 CIAO1O76071 339 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 SRGNP10124 158 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 NPR1P16066 1061 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 MASTLQ96GX5 879 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 CEP350Q5VT06 3117 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 ALDH1B1P30837 517 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 EYA2O00167 538 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 GRIN3BO60391 1043 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 TGFB2P61812 414 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 GRAPQ13588 217 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 STYK1Q6J9G0 422 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 BBOX1O75936 387 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 TMC4Q7Z404 712 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-202ENST00000395560 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms