RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 CSF1RP07333 972 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 LNPKQ9C0E8 428 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 SERPINB2P05120 415 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 NUCB1Q02818 461 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 PDE4AP27815 886 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 RGS3P49796 1198 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 NPHP1O15259 732 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 MMP10P09238 476 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 NYXQ9GZU5 481 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 ITGA6P23229 1130 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 CNBD1Q8NA66 436 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 COL4A1P02462 1669 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 LRRC24Q50LG9 513 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 SASH1O94885 1247 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 COPRSQ9NQ92 184 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN6-202ENST00000394765 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 SLC51AQ86UW1 340 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 ZBTB7AO95365 584 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 NLRP3Q96P20 1036 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 LAMB2P55268 1798 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 TFCP2Q12800 502 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 RAB11FIP3O75154 756 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 MYH3P11055 1940 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 ST5P78524 1137 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 EYA2O00167 538 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-202ENST00000394765 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.06■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 TAF1P21675 1872 aa22.06■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 CASZ1Q86V15 1759 aa22.06■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.05■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.05■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 RTL9Q8NET4 1388 aa22.05■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 SNAP23O00161 211 aa22.03■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 CIAO1O76071 339 aa22.03■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.03■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.03■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.03■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 CRY2Q49AN0 593 aa22.03■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 AACSQ86V21 672 aa22.03■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.03■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.02■■□□□ 1.12
UBXN6-202ENST00000394765 LRP5O75197 1615 aa22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 TAF5LO75529 589 aa22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 TIMM10P62072 90 aa22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 TNNI3KQ59H18 835 aa22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 METTL24Q5JXM2 366 aa22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UBXN6-202ENST00000394765 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms