RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393362.8

MAPK9-204, Transcript of mitogen-activated protein kinase 9, human

TSL 5

Gene MAPK9, Length 1,344 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAPK9-204	ENST00000393362	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		42.87	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	TAF1	P21675	1872 aa		42.87	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	COL4A5	P29400	1685 aa		42.86	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	FLII	Q13045	1269 aa		42.85	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	FSTL1	Q12841	308 aa		42.84	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	CEP350	Q5VT06	3117 aa		42.83	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	JDP2	Q8WYK2	163 aa		42.82	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		42.81	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	MPND	Q8N594	471 aa		42.8	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	COL4A1	P02462	1669 aa		42.79	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		42.78	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	42.78	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	TMC4	Q7Z404	712 aa		42.78	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		42.78	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		42.77	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	CCER2	I3L3R5	266 aa		42.77	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	PDE8A	O60658	829 aa		42.77	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		42.77	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	AOC3	Q16853	763 aa		42.76	■■■■■ 4.44
MAPK9-204	ENST00000393362	PPIP5K2	O43314	1243 aa		42.75	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	VPS33B	Q9H267	617 aa		42.75	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		42.74	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		42.73	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		42.73	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362		H7C1W4	665 aa		42.71	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	POTEI	P0CG38	1075 aa		42.71	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	POTEJ	P0CG39	1038 aa		42.71	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	APLP1	P51693	650 aa		42.71	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	GPC2	Q8N158	579 aa		42.71	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		42.7	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	NIM1K	Q8IY84	436 aa		42.7	■■■■■ 4.43
MAPK9-204	ENST00000393362	CACNA1F	O60840	1977 aa		42.69	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		42.69	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	GCKR	Q14397	625 aa		42.69	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		42.68	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		42.68	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362		F6X3S4	739 aa		42.67	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	GPSM2	P81274	684 aa		42.67	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	LINS1	Q8NG48	757 aa		42.66	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	HACL1	Q9UJ83	578 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362		E9PSI1	815 aa		42.64	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	CTSW	P56202	376 aa		42.64	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	HTRA3	P83110	453 aa		42.64	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	SLFN5	Q08AF3	891 aa		42.64	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	POLL	Q9UGP5	575 aa		42.64	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		42.64	■■■■■ 4.42
MAPK9-204	ENST00000393362	CASP7	P55210	303 aa		42.63	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		42.62	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		42.62	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	SCN4A	P35499	1836 aa		42.62	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	CXCL9	Q07325	125 aa		42.61	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	EPHX2	P34913	555 aa		42.6	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	BEND3	Q5T5X7	828 aa		42.6	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	CHADL	Q6NUI6	762 aa		42.6	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	GREM2	Q9H772	168 aa		42.58	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	C6orf229	H3BNL8	230 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	SCNN1D	P51172	638 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	WASHC4	Q2M389	1173 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MAPK9-204	ENST00000393362	LDHD	Q86WU2	507 aa		42.56	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		42.56	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	YDJC	A8MPS7	323 aa		42.55	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	42.55	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	42.55	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		42.55	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	RIMBP2	O15034	1052 aa		42.54	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	EPS15	P42566	896 aa		42.54	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	RAD17	O75943	681 aa		42.52	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	42.51	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	LTBP1	Q14766	1721 aa		42.51	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	RTL9	Q8NET4	1388 aa		42.51	■■■■■ 4.4
MAPK9-204	ENST00000393362	CSF1R	P07333	972 aa		42.5	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		42.5	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	MIER1	Q8N108	512 aa		42.49	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		42.49	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		42.49	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	42.48	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	EYA3	Q99504	573 aa		42.48	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	42.47	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		42.47	■■■■■ 4.39

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms